Zum Forschungsschwerpunkt Zeitgeschichte der Medizin gehören die Sondersammelgebiete Medizin und Gesellschaft im 20. Jahrhundert (MedZeitgeschichte) sowie Medizinische Ausbildung/Berufsfeld (MedBeruf, 1970 bis 2003) mit Literatur u.a. zu Gesundheitswesen/-politik, Sozialmedizin, Hochschulpolitik, Ausbildungsforschung.
Das Archivgut umfasst ca. 25.000 Medieneinheiten, darunter Sonderdrucke, Skripte, Briefwechsel, Gesetzestexte, Broschüren und Themenmappen, graue Literatur und Vor- bzw. Nachlässe, und ist online recherchierbar.

Das Krankenblatt- bzw. Psychiatriearchiv enthält Krankenakten aus der Psychiatrischen und Nervenklinik der Charité. Der umfangreiche Bestand umfasst den Zeitraum von 1880 bis 1976. Das Archiv ist Teil des Forschungsprojektes "Kulturen des Wahnsinns" und wird von einer Gruppe von WissenschaftlerInnen des Instituts betreut.

Die Dokumentation ist im Rahmen eines Forschungsprojektes entstanden und besteht aus einer Sammlung von etwa 1.000 Biografien von Ärztinnen, die in der Kaiserzeit tätig waren und damit anderen Frauen den Zugang zu einem bis dahin reinen Männerberuf ebneten. Über die Projektlaufzeit hinaus wird sie nun von Jutta Buchin um die Ärztinnen in der Weimarer Republik erweitert.

Die umfangreiche Bibliografie zur Geschichte der Charité (früher als Zettelkatalog der Zweigbibliothek Wissenschaftsgeschichte) ist in einer hausinternen Datenbank erfasst und kann nach Voranmeldung genutzt werden.